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重要生物信息中心简介(国外)
EMBnet,欧洲分子生物信息网(1982,1998,荷兰) http://www.embnet.org/
NCBI(GenBank),美国国家生物技术信息中心(1979,1988)http://www.ncbi.nlm..nih.gov/
NIG(DDBJ),日本国立遗传学研究所(1984,1987)http://www.ddbj.nig.ac.jp/
EBI,欧洲分子生物学研究所(1994,德国海德堡)http://www.ebi.ac.uk/
NCGR,美国国家基因组资源中心 http://www.ncgr.org/
JIPID,日本国际蛋白质信息数据库,它是PIR库的三个协作单位之一。
SIB,瑞士生物信息研究所http://www.isb-sib.ch/
BioBase,丹麦生物技术信息中心http://biobase.dk
重要生物信息中心简介(国内)
CBI或PKUCBI,北京大学生物信息中心(1997) http://www.cbi.pku.edu.cu/ 其可以立即进入EMBnet主页和若干重要生物数据库的镜象点(70多种)
BioSino, 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心http://www.biosino.org/ 是中国自己开发的核酸序列公共数据库。
AMMSnic,中国军事医学科学院情报研究所网络信息中心http://www.bmi.ac.cn/bio/
中国科学院遗传研究所人类基因组中心http://hgc.igtp.ac.cn
中国科学院国家基因组中心(1992)http://www.ncgr.ac.cn
中国科学院微生物研究所http://www.im.ac.cn/
CMBI/BJMU,北京大学医学部生物信息网页http://cmbi.bjmu.edu.cn
数据库目录:
从1994年开始,《核酸研究》杂志每年第一期是生物数据库专集,1998、1999、2000年分别介绍了102、105、114个数据库。2000年开始,可以通过下面网址,按字母或分类查找,并且立即链接到所需要的数据库。http://www.nar.oupjournals.org/
Dbcat,法国生物信息中心INFBIOOGEN维护的,建于1994年的生物数据库目录。北京大学生物信息中心有其镜象,2000年5月底列举了513种数据库。http://www.infobiogen.fr/services/adcat/
数据库类别:
数据库目录
综合数据库
DNA序列数据库
RNA序列和核糖体数据库
基因图谱数据库
人类基因组数据库
其他物种基因组数据库
基因表达数据库
基因突变、病理和免疫数据库
蛋白质序列数据库
蛋白质结构数据库
比较基因组学和蛋白质组学数据库
代谢途径和细胞调控数据库
与农林有关数据库
医学数据库
其他数据库
与家畜家禽有关的数据库
ChickGBASE, 鸡基因图谱计划,搜集全世界鸡基因图谱信息,包括标记、图谱、微卫星、命名规则、文献,以及与鸡基因图谱计划有关的单位名单等。http://www.ri.bbsrc.ac.uk/chickmap/chickbase/manager.html
Swinemap,猪基因图谱计划,包含染色体图谱和标记。http://sol.marc.usda.gov/genome/swine/swine.html/
PiGBASE,猪基因图谱信息库,设在英国Roslin研究所、美国农业部家畜基因组计划和美国衣阿华大学。http://www.ri.bbsrc.ac.uk/pigmap/arkpig/
SheepBase,新西兰牧业研究所建立,包含已发表的绵羊基因位点数据库。http://dirk.invermay.cri.nz/
HorseMap,马基因图谱数据库。http://www.ri.bbsrc.zc.uk/horsemap/arkhorse/
Bovmap,法国牛基因图谱数据库。
http://locus.jouy.inra.fr/cgi-bin/bovmap/intro.pl
[ 本帖最后由 孙悟空 于 2007-7-11 16:32 编辑 ] |
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